元は大薩摩踊りと称されていた大薩摩節（江戸古浄瑠璃で使われた人気の曲）で踊っていたものが、黒丸町で踊られた為に「大薩摩黒丸踊り」の名になり、次第に大薩摩が取れ、「黒丸踊り」になったのではないでしょうか？
長崎市のおくんちで、以前勝山町の出し物に「大薩摩」というのが有ったようですが、これとの関係は如何に？